Идея открытия в Шуше Карабахского филиала имени Хуршидбану Натаван Музея азербайджанской литературы имени Низами Гянджеви Академии наук Азербайджанской ССР была выдвинута в 1980 году, ремонтно-реставрационные работы в квартире удалось начать лишь в 1987 году.

Первым директором филиала был ученый-исследователь творчества Физули, кандидат филологических наук, член Союза писателей ССР Намиг Бабаев. Он привлек к работе музея деятельную молодежь и сумел сформировать хороший коллектив. Научный сотрудник Рахман Бахшалиев, младший научный сотрудник Мехсети Ахмедова, художник Эльдар Тагиев, сотрудник музея Маира Тагиева, самостоятельно занимающаяся поисками экспонатов и др.

Такой ученый как доктор филологических наук, профессор, прекрасный знаток карабахской литературной среды Назим Ахундов плечом к плечу трудился с этой молодежью, помогал ей как мог. В сложный период агрессии Армении против Азербайджана, период конфликтов, провоцируемых внутри страны другими нашими соседями, экспозиционные залы музея были капитально отремонтированы и сданы в пользование.

Сотрудники Музея азербайджанской литературы имени Низами Гянджеви проявили участливое отношение к благоустройству Карабахского филиала и оказали всю необходимую помощь для прибытия в Шушу.

Планировалось, что Карабахский филиал в дальнейшем будет вести научно-исследовательскую работу, объединит экспонирование в музее творчества поэтов и литераторов XIX века. Для сбора музеем необходимых материалов были налажены связи с людьми из Лачина, Кяльбаджара, Зангилана, Джебраила, Агдама, Губадлы, Бейлагана, Физули и других прилегающих районов. С первого дня создания музея были собраны богатый литературный материал, экспонаты, личные вещи писателей и поэтов, старинные книги и рукописи. Также, чтобы отразить атмосферу Карабахской литературной среды тех времен, была предпринята попытка собрать различные предметы быта.

Был составлен годовой план деятельности Музея карабахской литературы имени Х.Б.Натаван. В соответствии с планом, продолжается подготовка научных комментариев ко всем собранным в музее экспонатам и научной библиографии поэтов и писателей, творчество которых будет отображаться в музее. Собираются воспоминания старожилов-свидетелей определенных периодов истории Карабаха, образцы фольклора. Регулярно выступают в прессе директор музея Намиг Бабаев по темам «Анекдоты – украшение меджлисов, празднеств в Шуше», «В литературных поисках по краю, наши баяты и музыка», Рахман Бахшалиев – по теме «Фольклор в творчестве Гасым бека Закира» и др. Также публикуется цикл статей о живших в Шуше исторических личностях.