Историко-краеведческий музей Зангиланского района официально начал функционировать в 1980 году. Музей находился в районном центре, на улице Октября. В те годы был также изготовлен буклет с изображениями экспонатов музея.

В связи с исполнением постановления Бюро ЦК КП Азербайджана от 4 января 1980 года «Музейное дело в коммунистическом воспитании трудящихся» в Зангиланском районе был дан старт созданию историко-краеведческого музея. В связи с этим в статье, опубликованной в номере издаваемой в тот период в Зангиланском районе газеты «Kənd həyatı» («Сельская жизнь») от 12 мая 1980 года, отмечалось: «В районе ведется обширная работа по подготовке к открытию музея. Музей будет создан на видном месте в центре города, в здании, где раньше располагалась центральная библиотека…» Газета писала, что в здании проведен капитальный ремонт, и параллельно дан старт сбору экспонатов.

Напомним, что в тот период все музеи стандартно действовали в виде трех основных отделов.

Первый отдел охватывал информацию о природных ресурсах района, его флоре и фауне, второй отдел – период с древнейших времен до 1920 года. Третий отдел посвящался проведенной в районе за годы советской власти строительно-созидательной работе.

Первым директором музея был Алмамед Керимов. В 1987-1993 годы обязанности директора выполняла Диляра Исмаилова, в 1993-2005 годы – Натиг Рзаев. В период 2005-2012 гг. музей не функционировал. Свою деятельность он возобновил с 2013 года в городке для беженцев и вынужденных переселенцев в поселке Масазыр Абшеронского района. В 2013 году директором музея была назначена Гёйчак Рагимова.