Создание данного музея под открытым небом пришлось на июль месяц 1980-го года. А название «Гянджинские ворота Шушинской крепости» было связано с тем, что ворота обращены в сторону другого исторического города Азербайджана — Гянджа.
Для создания музея сотрудниками заповедника были собраны и привезены в музей приблизительно 70 экспонатов античного народного каменного зодчества. Позднее в музее выставлялись приблизительно 1250 каменных экспонатов, охватывающие разные периоды. Музей функционирует при Департаменте Культуры города Шуша и хранители отдела обеспечивают безопасность экспонатов музея.