Армяно-азербайджанский конфликт, именуемый также “Карабахский конфликт”, продолжается с 1988 года. Азербайджанская Республика вступила в войну еще будучи составной частью СССР, и продолжает вести ее уже в качестве независимого государства. Конфликт оказал решающее воздействие на все сферы национальной безопасности Азербайджана, существенно подорвав его позиции на начальном этапе становления государственности. В результате агрессии со стороны Армении было оккупировано 20 % территории республики. Погибло более 20.000 человек, более 50.000 было ранено, около 4.000 взяты в плен, заложниками, или пропали без вести. Более 1.100.000 граждан вынужденно покинули места постоянного проживания. Война нанесла не поддающийся реальному исчислению ущерб экономике Азербайджана. Были разрушены сотни населенных пунктов, многочисленные объекты промышленной, сельскохозяйственной, транспортной инфраструктуры Западного и Юго-Западного регионов республики. Увеличивающиеся военные расходы привели к нарастанию масштабов социально-экономического кризиса. Война способствовала воспроизводству внутриполитической нестабильности, спровоцировала рост регионально-этнического сепаратизма, существенно ослабила международные позиции Азербайджана. Негативное воздействие вышеперечисленных факторов сохраняется и на текущий момент.